La Dirección Ejecutiva tiene como objetivos gerenciar, dinamizar, modernizar y certificar en calidad la Asociación, con el propósito de convertirla en una empresa de los municipios con principios de eficiencia y eficacia, buscando una adecuada financiación que garantice la optimización de los recursos humanos, técnicos y administrativos.

Asimismo gestionará ante los diferentes niveles de gobierno y entidades subregionales, programas y proyectos para potencializar la capacidad de liderazgo y la generación de alternativas, buscando salidas a las problemáticas políticas, administrativas, socioeconómicas y culturales, con una Asociación con fuerza de negociación.

La Dirección Ejecutiva generará entonces espacios amplios y dinámicos para la participación institucional, gremial y comunitaria, promoviendo el desarrollo integral de los municipios y defendiendo los intereses de la subregión ante instancias supramunicipales. Se administrarán y gestionarán recursos para el desarrollo de la subregión y sus municipios con principios de transparencia y acatamiento normativo.